آفت خاصی نخل مرداب را تهدید نمی کند. تنها حشره ای که ممکن است این گیاه را مورد حمله قرار دهد کنه تار عنکبوتی می باشد.
- پوسیدگی ریشه‌ها: آبیاری زیاد این مشکل را به وجود می آورد.
- زرد شدن برگ‌ها: برگ‌های شامادورا به‌علت کافی نبودن عناصر ضروری برای رشد، تغییر رنگ می‌دهند.
- شپشک و کنه تارعنکبوتی از مهمترین آفاتی هستند که میتوانند برای نخل شامادورا مشکل ساز شوند.